Tachán existe un paquete que te hace todo esto.
Instalar el paquete installr para actualizar R
1. Si usas la GUI debes ir a Paquetes y buscar installr que es el paquete que te instalará2.Elegimos: installr
en la lista
3.Ahora a por un poco de código (de copy-paste), para que no sé diga que si los que usan windows...
library(installr)
updateR()
4.Vamos, super simple: llamamos a la librería y actualizamos RInstalando R
5. Nos pregunta que si queremos instalar la versión nueva. Bueno, pues sí, porque eso es lo que queremos.6. Y se baja y se empieza a instalar...
7. Y una vez terminado, si estamos animado podemos actualizar los paquetes que tenemos, así ya de paso.
Documentación del paquete installr
8. La documentación sobre installr , el paquete para instalar R está por aquí http://cran.r-project.org/web/packages/installr/index.html. Incluso te avisa si no necesitas actualizar porque tienes la última versión del programa.Así que aquí me hallo con mi flamante nueva versión, apuntico de salir la 2.0
R version 3.1.3 (2015-03-09) -- "Smooth Sidewalk"
P.D. La verdad que es un paquete muy cómodo y muy recomendable.